Le contrôle du coût par CFE permet de suivre le coût dans la logique de la méthode par éléments en gérant le devis initial à l'aide du code de frais par élément. Ceci permet d'associer à tout moment le quantitatif à l'analyse du coût de construction et d'obtenir ainsi automatiquement les prix référentiels indispensables pour leur réutilisation lors de l'établissement de nouvelles estimations.
Le contrôle du coût fonctionne exactement comme le contrôle du coût traditionnel, sauf que le CFC est remplacé par le CFE et que par conséquent les contrats et les paiements sont structurés selon le CFE. Ainsi l'analyse du coût par CFE, mise en relation avec le quantitatif du projet donne immédiatement et lors de l'affinage financier du projet déjà, le prix référentiel et les chiffres indicatifs réels du projet et immédiatement réutilisables pour de nouvelles estimations.

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